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联赛阶段欧冠冠军和“欧战积分”排名前8的俱乐部为第一档球队（即种子队），其余27支队伍根据“欧战积分”分为二三四档。每支球队将与4个分档中分别随机抽取的2队共8支球队各进行一场比赛，主客场由抽签决定需保证每支球队有4个主场和4个客场，同协会球队不会相遇，每支球队最多只能与来自同一协会的两支球队相遇。淘汰赛每轮比赛均为主客场两回合，如遇不可抗力会安排在中立场地进行比赛；决赛在中立场地进行。淘汰赛附加赛抽签规则：联赛阶段积分9-16的球队为种子队，积分17-24柠檬足球网的球队为非种子队，种子队与非种子队进行主客场两回合比赛，非种子队先主后客，优胜者进入16强。1/8决赛抽签规则：联赛阶段积分1-8的球队为种子队，淘汰赛附加赛优胜的8队为非种子队，种子与非种子队进行主客场两回合比赛，非种子队先主后客，优胜者进入8强。

2008年9月26日，欧足联宣布从2016年起，欧洲足球锦标赛决赛阶段参赛球队的数量扩大到24支。 2020年3月12日，根据欧足联官网消息，鉴于新冠肺炎疫情在欧洲不断蔓延，以及世界卫生组织对疫情的更新评估，欧足联决定，将邀请55个成员协会代表、欧洲俱乐部协会和各个联赛柠檬足球网的代表于3月17日举行视频会议，届时讨论欧洲足球赛事应对疫情的下一步措施。

若两队或多队出现积分相同，则比较相关球队间对战战绩，柠檬足球网若还不能确定出线球队，则需比较小组赛全部比赛的净胜球数、进球数及客场进球数决定出线席位。