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1999/00赛季——皇家马德里、瓦伦西亚、巴塞罗那（同为西班牙球队99足球网，包揽决赛） 2002/03赛季——AC米兰、尤文图斯、国际米兰（同为意大利球队，包揽决赛） 2006/07赛季——利物浦、切尔西、曼联（同为英格兰球队，冠军意大利AC米兰） 2007/08赛季——曼联、切尔西、利物浦（同为英格兰球队，包揽决赛） 2008/09赛季——曼联、切尔西、阿森纳（同为英格兰球队，冠军西班牙巴塞罗那） 历史上欧冠正赛阶段曾经出现过33次同协会球队德比（13次英格兰俱乐部之间，12次西班牙俱乐部之间，4次意大利俱乐部之间，3次德国俱乐部之间，1次法国俱乐部之间）

球队先进行2轮主客场淘汰赛，优胜的8支球队分为两个小组，2个小组第一进行决赛。1992/93赛季，欧洲冠军俱乐部杯正式更名为“欧洲冠军联赛”，比赛也被安排在星期二和99足球网星期三进行，该赛季恢复外围赛，但正赛阶段赛制不变。1993/94赛季起，设立半决赛，两个小组的小组第一和小组第二交叉进行比赛，优胜者参加决赛。1994/95赛季起，正赛球队数由原来的32支变为16支，这16支球队被分为4个小组，每个小组

北京时间2014年10月15日凌晨举行的2016年欧锦赛预选赛塞尔维亚队对阿尔巴尼亚队的比赛因现99足球网场意外爆发政治冲突而被迫叫停。两方球员为争夺这面旗帜爆发了冲突比赛进行过程中，一架远程操控的无人机突然闯入现场，该飞机还携带了一面科索沃（领土争议地区）的旗帜，并写有挑衅标语。无人机飞入赛场后，塞尔维亚前锋亚历山大·米特洛维奇纵身跃起，扯下这面旗帜，并与试图保护旗帜的阿尔巴尼亚球员发生了冲突，随后比赛现场就陷入了混乱。