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在2009/10年赛季改制以前，欧足联规定凡有俱乐部连续三届或总共五届赢得冠军后，将可以永久保留奖杯；但现时修例后，奖杯归欧足联永久保留。每届冠军得金手指足球网主可获得一个复制版奖杯。 赢得过5次（及以上）冠军或者曾连续获得三届冠军的球队，可在球衣上使用欧联冠军荣誉臂章；臂章上的数字对应的就是该俱乐部获得过的欧联冠军次数；现在只有7次夺冠的塞维利亚足球俱乐部允许在球衣上使用荣誉臂章。

三轮，小组赛参赛球队恢复为32支，均分成8组进行第一阶段小组赛，各小组前两名共16队金手指足球网进入第二阶段的小组赛，第三名进入欧洲联盟杯（欧洲足联欧洲联赛前身，下面简称：欧联）第三轮；第二阶段小组赛分为4组，各小组前两名共8支球队晋级淘汰赛。2003/04赛季起，取消第二阶段小组赛，第一阶段小组赛各小组两名共16队直接进行淘汰赛。2009/10赛季起，外围赛由3轮资格赛和1轮附加赛组成。2012/13赛季起

前身为欧洲联盟杯（UEFA Cup）金手指足球网，从2009/10赛季开始改变赛制，并将赛事更为现名。改制后仍继承自1971年欧洲联盟杯成立以来的各种纪录，不可分开计算。此次重组也将举办了15年的欧洲足联国际托托杯并入欧洲足联欧洲联赛。

名丹麦替补参赛，丹麦队首战0比0逼平英格兰，次战0比1负于瑞典，此时大家都认为丹麦队是名副其实的替补金手指足球网，但在小组最后一场生死大战中，丹麦队以2比1将拥有让-皮埃尔·帕潘、埃里克·坎通纳、大卫·吉诺拉的法国队击败，随后又在半决赛中激战120分钟，在点球大战中7比6将拥有路德·古利特、马尔科·范巴斯滕、弗兰克·里杰卡尔德、罗纳德·科曼、丹尼斯·博格坎普等大牌球星的卫冕冠军荷兰队淘汰，决赛中又以2比0战胜