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联赛阶段欧冠冠军和“欧战积分”排名前8的俱乐部为第一档球队（即种子队），其余27支队伍根据“欧战积分”分为二三四档。每支球队将与4个分档中分别随机抽取的2队共8支球队各进行一场比赛，主客场由抽签决定需保证每支球队有4个主场和4个客场，同协会球队不会相遇，每支球队最多只能与来自同一协会网易足球网的两支球队相遇。淘汰赛每轮比赛均为主客场两回合，如遇不可抗力会安排在中立场地进行比赛；决赛在中立场地进行。淘汰赛附加赛抽签规则：联赛阶段积分9-16的球队为种子队，积分17-24的球队为非种子队，种子队与非种子队进行主客场两回合比赛，非种子队先主后客，优胜者进入16强。1/8决赛抽签规则：联赛阶段积分1-8的球队为种子队，淘汰赛附加赛优胜的8队为非种子队，种子与非种子队进行主客场两回合比赛，非种子队先主后客，优胜者进入8强。

2004年特别打造一只全金版本的奖杯颁予阿森纳，以表扬其全网易足球网季不败夺冠的功绩。

奖杯和臂章 欧足联规定，赢得5次欧冠冠军或者连续赢得三届冠军的球队，都可以永远保留原始奖杯。1966年，第六次夺冠的皇家马德里永远留住了第一座原始网易足球网奖杯，那座奖杯外形别致小巧，人人都可以轻松地把它举过头顶。由于奖杯被永久收藏，欧足联请瑞士专家斯塔德尔曼重新设计了一座奖杯，新奖杯高 74 厘米，重 11 公斤，即“大耳朵杯”。阿贾克斯、拜仁慕尼黑、AC米兰和利物浦都先后各收藏了一座大耳朵杯。2009年欧足联规定奖杯不再被永久保留，夺冠的球队必须在下赛季的决赛之前将奖杯交还，不过他们可以保留一座复制品，但复制的奖杯不能超过原件大小的五分之四。