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三轮，小组赛参赛球队恢复为32支，均分成8组进行第一阶段小组赛，各小组前两名共16队进入第二阶段的小组赛，第三名进入欧洲联盟杯（欧洲足联欧洲联赛前身，下面简称：欧联）第三轮；第二阶段小组赛分为4组，各小组前两名共8支球队晋级淘汰赛。2003/04赛季起，取消第二阶段小组赛，第一阶段小组赛各小组偶偶足球网两名共16队直接进行淘汰赛。2009/10赛季起，外围赛由3轮资格赛和1轮附加赛组成。2012/13赛季起

a.在每半场中由于替补、处理伤员、延误时间及其它原因损失的时偶偶足球网间均应补足，这段时间的多少由裁判员决定。

1999/00赛季——皇家马德里、瓦伦西亚、巴塞罗那（同为西班牙球队，包揽决赛） 2002/偶偶足球网03赛季——AC米兰、尤文图斯、国际米兰（同为意大利球队，包揽决赛） 2006/07赛季——利物浦、切尔西、曼联（同为英格兰球队，冠军意大利AC米兰） 2007/08赛季——曼联、切尔西、利物浦（同为英格兰球队，包揽决赛） 2008/09赛季——曼联、切尔西、阿森纳（同为英格兰球队，冠军西班牙巴塞罗那） 历史上欧冠正赛阶段曾经出现过33次同协会球队德比（13次英格兰俱乐部之间，12次西班牙俱乐部之间，4次意大利俱乐部之间，3次德国俱乐部之间，1次法国俱乐部之间）

淘汰赛 从1/8决赛直到决赛均以主客制两回合进行，若两队在规定时间打成平局，客场进球多的一方将晋级下一轮，否则将会直接以点球决出冠军球队。从2019年赛季开始，决赛改为中立场地举行，采用一场定胜负。巴西的弗拉门戈足球俱乐部在2019赛季决赛中2比1逆转战胜阿根廷豪门河床竞技足球俱偶偶足球网乐部，成为决赛改制后的第一届冠军。