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三轮，小组赛参赛球队恢复为32支，均分成8组进行第一阶段小组赛，各小组前两名共16队进入第二阶段的小组赛，第三名进入欧洲联盟杯（欧洲足联欧洲联赛前身，下面简称：香港足球网欧联）第三轮；第二阶段小组赛分为4组，各小组前两名共8支球队晋级淘汰赛。2003/04赛季起，取消第二阶段小组赛，第一阶段小组赛各小组两名共16队直接进行淘汰赛。2009/10赛季起，外围赛由3轮资格赛和1轮附加赛组成。2012/13赛季起

掷球时，掷球队员必须面向球场，两脚均应有一部分站香港足球网立在边线上或边线外，不得双脚离地，用双手将球从头后经头顶掷入场内。球一进场内比赛立即恢复。掷球队员在球被其他队员踢或触及前，不得再次触球。掷界外球不得直接掷入球门得分。

智利（Chile）在这届世界杯上先后使用过两个官方香港足球网用球，其中一款与上届世界杯的“Telstar”十分类似。另一款“Chile”则恢复成全白色足球，因为该设计与1962年智利世界杯时曾使用过的一款全白色足球酷似，所以得名于此。