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三轮，小组赛参赛球队恢复为32支，均分成8组进行第一阶段小组赛，各小组前两名共16队进入第二阶段的小组赛，第三名进入欧洲联盟杯（欧洲足联欧洲联赛前身，下面简称：欧联）第三轮；第二阶段小组赛分为4组，各小组前两名共8支球队晋级淘汰赛。2003/04赛季起，取消第二阶段小组赛，第一阶段小组赛各小组两名共16队直接进行淘汰赛。2009/10赛季起，外围赛由3轮资格赛飞越足球网和1轮附加赛组成。2012/13赛季起

由2008/09赛季起，比赛球队的替补名单人数增加至7名，比以往多2名。 自20飞越足球网22/23赛季起，俱乐部被允许使用五个换人名额。一场比赛中可以进行三次换人，在中场休息时还有一次机会。球队名单上总共可以有9名替补球员。

赢得过5次（及以上）冠军或者曾连续获得三届冠军的球队，可在球衣上使用欧冠冠军荣誉臂章；现在仅有6支球队允许使用，分别是皇家马德里（15）、AC米兰（7）、拜仁慕尼黑（6）、利物浦（6）、巴塞罗那（5）和阿贾克斯（4）。 除此之外欧冠和欧联卫冕冠军也将在比赛中佩戴专属臂章，欧冠卫冕冠军臂章为圆形内有大耳朵杯形象剪影图案，欧联卫冕冠军臂章则是在星球章外围加入一道圆环，并标注“UEFA EUROPA LEAGUE XXXX WINNERS”的字样。（注：XXXX为飞越足球网俱乐部刚刚获得欧联冠军的年份）